Calculadora de número de copias de ADN

¿Alguna vez te has preguntado cuántas copias de un gen específico hay en tu ADN? ¡Con nuestro DNA Copy Number Calculator, ahora puedes descubrirlo! Esta herramienta innovadora te permite calcular el número de copias de un gen en tu ADN de manera rápida y sencilla. ¡Averigua más sobre cómo funciona y cómo puede ayudarte a aprender más sobre tu propia genética en este artículo!

Bienvenido a la Calculadora de número de copias de DNA!

Puedes utilizar esta calculadora para convertir nanogramos (ng) de DNA a su número de copias en tus corridas de PCR. También puedes utilizar la calculadora en dirección contraria para determinar la solución de stock de DNA para un número específico de copias de DNA o RNA por microlitro.

Calculadora de número de copias de DNA

Introduce los siguientes valores para calcular el número de copias:

Concentración de DNA (ng/µL):

Longitud del template (bp):

Tipo de DNA:
DNA de cadena simpleRNA de cadena simpleDNA de doble cadena

Calcular Número de Copias

Bienvenido al Calculador de Número de Copias de ADN!

Puedes utilizar este calculador para tus carreras de PCR para convertir nanogramos (ng) de ADN a su número de copias. También puedes utilizar el calculador al revés para determinar la solución de stock de ADN para un número específico de copias de ADN o ARN por microlitro.

En esta herramienta, puedes elegir entre ADN de una o doble cadena o ARN de una sola cadena. ¡Salta directamente al cálculo o sigue leyendo para:

Aprender la fórmula del calculador;

Pasar por un ejemplo paso a paso;

Entender cómo calcular la dilución de tu muestra de stock;

Aprender a calcular el número de copias por ciclo de PCR; y

Obtener una visión general sobre qué factores influyen en el número de copias y tus resultados de PCR 🧬.

Secuencias de ADN específicas se copian al realizar PCRs, dependiendo de diferentes parámetros. La cantidad de copias hechas por volumen específico es esencial para configurar correctamente nuestra muestra para análisis posteriores como ensayos de secuenciación de ADN.

Utiliza esta fórmula base del calculador de número de copias de ADN para calcular el ARN o ADN en nanogramos (ng) a su número de copias:

CDNA𝐶𝐷𝐶NDNAADNA​— Concentración de ADN, en ng/µL (ver nuestro calculador de concentración de ADN);

NANA— Constante de Avogadro — 6.022×10²³ (ver nuestro calculador de número de Avogadro);

lll — Longitud de la plantilla, en pares de base (pb);

ng — Factor de conversión a nanogramos — 1×10⁹; y

wbpADNwpADN— Peso promedio de una base o par de bases, en daltons (Da).

En nuestro calculador de número de copias de ADN, puedes elegir entre nucleótidos de ADN de una sola o doble cadena (ADN de cs/ssRNAdd cs/ssRNA) y pares de bases de ADN de doble cadena (ADN de cd) para el peso de base promedio. El calculador utiliza los siguientes valores:

1. ADN de cs — 330 Da;
2. ARN de cs — 340 Da; y
3. ADN de cd – 660 Da.

Veamos algunos ejemplos a continuación para entender cómo utilizar esta fórmula y el calculador para determinar el número de copias del gen🧪!

1. Calcular el número de copias

Supongamos que medimos una concentración de muestra de stock de ADN CDNAC𝐶𝐷𝐶NDNAª de 150 ng/µL. La longitud total de la plantilla lll es de 4,700,000 pares de bases. Dado que tenemos ADN de doble cadena, elegiremos el peso estándar de la base wpADN de 660 daltons.

Ahora queremos saber cuántas copias del gen hay en 1 µl de esta muestra:

NDNANADNAª— Número de copias por microlitro;

6.022×10²³— Constante de Avogadro; y

1×10⁹ — es el factor de conversión a nanogramos.

¿Necesitas tu volumen en mililitros? ¡Nuestro convertidor de volumen está aquí para ayudarte!

1. Calcular dilución de stock

Ahora supongamos que necesitamos un volumen total de pipeta de 10 µL con una concentración final de 2,000,000 copias/µL. Con el resultado anterior, ahora solo necesitas dividir la concentración calculada por la concentración deseada y multiplicarla por el volumen total de pipeta deseado:

Por lo tanto, necesitarías pipetear 0.68 µL de la solución de stock con 10-0.676=9.32 µL de agua.

Si conoces los números de copias necesarios para un análisis posterior, es posible que desees determinar cuántos ciclos de PCR necesita tu PCR.

En nuestro calculador, puedes determinar el número de copias después de un cierto número de ciclos de PCR o cuántos ciclos de PCR necesitarás para alcanzar un número específico de copias simplemente abriendo la sección de copias de ADN por ciclo de PCR.

El calculador estima el número de copias de ADN o ARN después de una cierta cantidad de ciclos de PCR con la siguiente fórmula sencilla:

NDNANADNAª— Número de copias de ADN después de n ciclos;

iii — Número inicial de copias de ADN; y

nnn — Número de ciclos de PCR.

Si deseas saber, por ejemplo, el número de copias después de 10 ciclos de PCR con un número inicial de 1.4×10⁵ copias de ADN/µl:

¿Quieres recordar tus conocimientos sobre exponentes y terminar tu cálculo aún más rápido? Nuestro calculador de crecimiento exponencial está aquí para ayudarte.

Si no estás satisfecho con los resultados de tu PCR, verifica los siguientes puntos y asegúrate de seguir todas las instrucciones de tu kit de PCR elegido correctamente.

1. La cantidad recomendada de plantilla de ADN es de 25 a 100 ng por volumen de reacción de 100 µL.
2. Nuestro calculador de temperatura de anillado será de gran ayuda para ajustar tus parámetros de ciclador correctamente.
3. Verifica que tus cebadores estén diseñados específica o inespecíficamente y funcionen correctamente. Verifica la funcionalidad de todos los demás componentes de la PCR (nucleótidos, buffers, polimerasa).
4. Asegúrate de que tu ADN de plantilla no contenga demasiado ADN (amplificación no específica) o muy poco ADN (bajos rendimientos).
5. Investiga por inhibidores como sales biliares, hemo de muestras de sangre, urea de muestras de orina, medio de transporte viral, heparina y formalina, entre otros.

Utiliza esta fórmula para calcular el número de copias de ADN:

Copias de ADN/μL = (concentración de ADN [ng/μL] × constante de Avogadro) / (longitud de la plantilla [pb] × factor de conversión a nanogramos × peso de la base (par) [Da])

donde:

La constante de Avogadro es 6.022×10²³.

El factor de conversión a nanogramos es 1×10⁹.

El peso promedio de una base o par de bases es:

1. 660 para ADN de cd,
2. 330 para ADN de cs, y
3. 340 para ARN de cs.

2.8×10⁴⁶ copias/μL si asumimos un número inicial de 1.4×10⁵ copias de ADN/μL en la solución de stock. Utiliza la siguiente ecuación para verificar el resultado:

N = i × (2ⁿ)

donde:

N — Número de copias de ADN después de n ciclos;

i — Número inicial de copias de ADN; y

n — Número de ciclos de PCR.

Para nuestro ejemplo:

N = 1.4×10⁵ × (2⁴⁰) = 2.8×10⁴⁶ copias/μL

Sí, la PCR amplifica el ADN entre los dos cebadores agregados de manera exponencial, con el número de copias de ADN duplicándose después de cada ciclo para que después de n ciclos tengas 2ⁿ copias. Sin embargo, cuando los reactivos en la muestra de PCR se vuelven limitantes, la amplificación llega a un punto de meseta.

Las variaciones en el número de copias (cnv) son una ocurrencia natural en la que el número de copias de un segmento específico de ADN varía entre los genomas de los individuos. Juegan un papel esencial en la evolución, contribuyen a la diversidad de la población y al desarrollo de ciertas enfermedades.

Podemos detectar estas variaciones en la repetición de secuencias genómicas con métodos de secuenciación como NGS.